Film, Star Trek Discovery dizisinden tanıdığımız İmparator Philippa Georgiou karakterinin maceralarını konu alıyor.
Eski Ayna Evreni imparatoriçesi Philippa Georgiou, Yıldız Filosu'nun gizli operasyonlar bölümü olan Section 31'e katılır. Bu bölüm, Federasyon'u korumak için her türlü yöntemi kullanma yetkisine sahip, ahlaki açıdan gri bir alanda faaliyet göstermektedir. Kural ve düzenlere bağlı kalmaktansa, amaca ulaşmak için her yolu mübah gören bu örgüt, Federasyon içinde bile tartışmalı bir konumdadır. Georgiou, Section 31'daki yeni görevinde, Birleşik Gezegenler Federasyonu'nu büyük ölçekli bir tehdide karşı korumakla görevlendirilir. Bu tehdit, Federasyon'un temellerini sarsabilecek ve galaktik düzeni bozabilecek kadar güçlü ve gizemlidir. Georgiou, bu tehdidin kaynağını bulmak ve onu ortadan kaldırmak için zekasını, stratejik becerilerini ve gerektiğinde acımasızlığını kullanmak zorunda kalacaktır. Görevi sırasında, Georgiou sadece dış tehditlerle değil, aynı zamanda kendi içsel çatışmalarıyla da mücadele etmek zorundadır.